Les agents du Parc naturel marin sont particulièrement attentifs à l'apparition d'espèces exotiques. Actuellement, deux d'entre elles sont sous haute surveillance.
L'IPBES a publié son rapport d'évaluation sur les espèces exotiques envahissantes. Localement, le Parc suit l'espèce exogène Caulerpa racemosa qui pourrait provoquer un déséquilibre.